橫琴島澳門大學新校區河底隧道工程分為水中段、澳門段及橫琴段三部份。工程自2010年11月5日奠基後，現時所有結構基礎樁、止水樁、地基加固樁及支護樁等已進入完工階段。由於工期緊迫，工程子項目必須以交叉作業方式同時進行。水中、澳門及橫琴三段工程的基坑開挖工作現已全面開展，同時主體結構亦已緊隨其後進行施工。