橫琴島澳門大學新校區回填及軟土地基處理工程已全面開展，工程主要目的是進行軟地基處理，以減低有關填土地日後可能出現的自然沉降問題，工程同時會將施工地段土地的高程提升兩米，以配合有關設計方案，填土工程的開展亦為項目下一階段的施工創造條件。

整項工程的回填量約為五百萬立方米，軟土地基處理面積約1平方公里，工程將分階段進行；第一階段回填工作為校區整體回填至+4.0高程，按各單體建築的建設計劃安排，由第一期標誌性建築物區域(約為整體的10%)開始回填；第二階段工作為進行軟基處理工程，包括插打垂直排水帶、進行真空預壓處理及堆載預壓處理；第三階段工作是在完成軟基處理後，按各區的實際設計高程進行第二次回填。