As obras de construção da ETAR do Aeroporto Internacional de Macau arrancaram em 2003, tendo depois entrado oficialmente em funcionamento a partir de princípios de 2005. A sua principal função consiste em dar um pré-tratamento às águas residuais com elevada concentração de poluentes produzidas pela actividade de restauração do Aeroporto Internacional de Macau, pelo que foi projectado para o tratamento diário de 685 m3 de água residual. As suas principais instalações se encontram no quadrante sul do parque de estacionamento a sul do Aeroporto Internacional de Macau e ocupa uma área de aproximadamente 1.300 m2. A água residual percorre um colector de aproximadamente 800 m de comprimento desde o quadrante norte do aeroporto até chegar às instalações principais desta ETAR.

A tecnologia de ponta, com base no tanque de flutuação por ar dissolvido e no tanque biológico percolador, utilizada pela ETAR do Aeroporto Internacional de Macau, compreende num total de 3 linhas de tratamento biológico. Na fase de pré-tratamento, a água residual é sujeita ao processo de separação de sólidos por gradagem, composto por grades grossas e grades finas, desarenamento nas caixas de areia e desengorduramento nas caixas de gordura, seguindo depois para decantação nos chamados reactores biológicos, podendo então depois de ser tratada ser encaminhada para a rede pública de drenagem.

As instalações da ETAR do Aeroporto Internacional de Macau são todas fechadas hermeticamente e equipadas com sistema de biodesorodorização e sistema de eliminação urgente de odores por meio de filtros de carvão activado, com vista a garantir assim que não venha isto ter impacto nas imediações das instalações do ETAR. E o lodo resultante do tratamento de águas residuais, depois de desidratado, é encaminhado para incineração na ETAR da Península de Macau.